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西藏自治區疾病預防控制中心成立于2004年1月18日，是在原西藏自治區衛生防疫站基礎上組建而成的公益性事業單位，隸屬西藏自治區衛生健康委員會。中心承擔著全區傳染性疾病、慢性非傳染性疾病、學生常見病、病媒生物傳播疾病與控制、突發公共衛生事件處置和疫情報告和信息管理；食品衛生、環境衛生飲用水監測職業衛生等健康危害因素的監測，還承擔著自治區重大政治、經濟、社會活動的公共衛生保障等任務。

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